A ASSOCIAÇÃO das Irmãs Franciscanas de São José fundamenta sua missão no carisma: A Misericórdia. Para concretizar e manter vivo esse carisma, as associadas prestam serviços resgatando a dignidade humana, a autonomia e o direito das pessoas a serem atendidas em suas necessidades básicas, sem qualquer discriminação de nacionalidade, credo, política, cor, raça ou religião, dentro de suas possibilidades, através do serviço de seus membros.